設計探針
⑴ EMSA探針設計
探針是來一小段單鏈自DNA或者RNA片段（大約是20到500bp），用於檢測與其互補的核酸序列。雙鏈DNA加熱變性成為單鏈，隨後用放射性同位素（通常用磷-32）、熒光染料或者酶（如辣根過氧化物酶）標記成為探針。磷-32通常被摻入組成DNA的四種核苷酸之一的磷酸基團中，而熒光染料和酶與核酸序列以共價鍵相連。
當將探針與樣品雜交時，探針和與其互補的核酸（DNA或RNA）序列通過氫鍵緊密相連，隨後，未被雜交的多餘探針被洗去。最後，根據探針的種類，可進行放射自顯影、熒光顯微鏡、酶聯放大等方法來判斷樣品中是否，或者何位置含有被測序列（即與探針互補的序列）。
⑵ 如何設計tagman探針
下載相關的設計軟體，閱讀其說明書。
推薦個：primer express 3.0，這個是ABI推出專門用來設計tagman探針的。說明書和破解版網上都能下到。
⑶ 求助怎麼設計mirna引物及探針
miRNA引物設計（莖環法+染料法檢測）
設計方法：通用莖環後端加miRNA後面6個鹼基的反向互補序列為反內轉錄引物，正向引物為容miRNA去除後面6個鹼基的序列，反向引物在莖環上。
反轉錄莖環通用序列：miRNA序列：
>mmu-miR-99b-5p
MIMAT0000132 Mus musculus miR-99b-5p
CACCCGUAGAACCGACCUUGCG
mmu-miR-99b-5p反轉錄頸環引物為：
CGCAAG
定量PCR反向引物為：TGTCGTGGAGTCGGC
正向引物為：CACCCGTAGAACCGAC
⑷ 如何針對一種物質設計熒游標記探針
1.探針分抄為好多種，你要先襲決定你用何種，是RNA探針還是DNA探針，雜交時，RNA－RNA結合的穩定性要比DNA－RNA好，所以RNA探針具有結合牢固、背景低等優點；DNA探針背景稍微深一些，不過也可以，標記方法比前者簡單一些，另外還有寡核苷酸探針，此類探針分子量小，通透性好，但就是標記的敏感性不高。
2.原位雜交相比免疫組化，定位相對准確，但如果蛋白在間質中發揮作用，原位雜交就檢測不出來了，結合圖像分析，原位雜交也可以對目的基因的轉錄半定量。
3.首先是標本對照，這個包括陽性對照和陰性對照；第二個是探針對照，主要是明確探針的特異性；第三個是探針正義連陰性對照，第四個未標記探針競爭抑制；第五個不含探針的陰性對照；第六個質粒對照，第七個無關探針對照。
4.若要定量，該試驗不可行，還是作Northern，若要顯示形態、定位，最好結合免疫組化。
⑸ dna雜交探針設計一般用什麼修飾
將此重組質粒標記後作探針進一步鑒定。細菌的基因組大小約5×106bp，常常是比較繁瑣的。這些DNA探針的獲得有賴於分子克隆技術的發展和應用、原蟲、動物和人類細胞DNA探針，產生雜交信號的克隆被剔除DNA分子雜交技術用什麼做探針 DNA探針是最常用的核酸探針，它所編碼的蛋白是該菌種所特有的、真菌、病毒，即將細菌DNA切成小片段後分別克隆得到包含基因組的全信息的克隆庫。然後用多種其它菌種的DNA作探針來篩選，或某一非編碼序列，所不同的是所建DNA文庫為可表達性，亦可經DNA序列分析鑒定其基因來源和功能。用這種表達文庫篩選得到的顯然只是特定基因探針，克隆菌落或噬斑經裂解後釋放出表達抗原。因此要得到一種特異性DNA探針。這些DNA片段須是特異的，約含3000個基因，所得到多個陽性克隆再經其它細菌的抗血清篩選。各種細菌之間絕大部分DNA是相同的，指長度在幾百鹼基對以上的雙鏈DNA或單鏈DNA探針。現已獲得DNA探針數量很多。以細菌為例，然後用來源細菌的多克隆抗血清篩選陽性克隆，要獲得某細菌特異的核酸探針，通常要採取建立細菌基因組DNA文庫的辦法，最後剩下的不與任何其它細菌雜交的克隆則可能含有該細菌特異性DNA片段。探針DNA克隆的篩選也可採用血清學方法，分子雜交技術用於細菌的分類和菌種鑒定比之G+C百分比值要准確的多，是細菌分類學的一個發展方向。這類探針多為某一基因的全部或部分序列。加之分子雜交技術的高敏感性，最後只與本細菌抗血清反應的表達克隆即含有此細菌的特異性基因片段，如細菌的毒力因子基因探針和人類Alu探針，分子雜交在臨床微生物診斷上具有廣闊的前景，有細菌
⑹ 有會引物和探針設計的嗎
引物是用來擴增片段用的，而探針，探針上面有熒光基團，完整時檢測不到熒光，與兩引物之間的目的基因結合。
PCR擴增過程中，探針被切斷，可以檢測到熒光。擴增得到的目的基因越多，那麼探針被切斷的也越多，檢測到的熒光也越多，所以常用來做定量PCR。
增加特異性的引物所具有的特點：
(1)序列選取應在基因的保守區段；
(2)擴增片段長度根據技術的不同有所分別：
(3) sybr green I技術對片段長度沒有特殊要求；
(4)Taqman探針技術要求片段長度在50bp－150bp；
(5)避免引物自身或與引物之間形成4個或4個以上連續配對；
(6)避免引物自身形成環狀發卡結構；
(7)典型的引物18到24個核苷長。引物需要足夠長，保證序列獨特性，並降低序列存在於非目的序列位點的可能性。但是長度大於24核苷的引物並不意味著更高的特異性。較長的序列可能會與錯誤配對序列雜交，降低了特異性，而且比短序列雜交慢，從而降低了產量。Tm值在55－65℃，GC含量在40%－60%；
(8)引物之間的TM相差避免超過2℃；
(9)引物的3』端避免使用鹼基A；
(10)引物的3』端避免出現3個或3個以上連續相同的鹼基。
(11)為避免基因組的擴增，引物設計最好能跨兩個外顯子。
⑺ 引物設計和探針設計有什麼區別
引物是用來來擴增片段用的，自而探針，探針上面有熒光基團，完整時檢測不到熒光，與兩引物之間的目的基因結合，PCR擴增過程中，探針被切斷，可以檢測到熒光。擴增得到的目的基因越多，那麼探針被切斷的也越多，檢測到的熒光也越多，所以常用來做定量PCR。
⑻ Padlock 探針設計
這些專業的問題，可以上忽米網找找專業人士問問。
⑼ 如何用primer3設計taqman探針
探針是一小段單鏈DNA或者RNA片段（大約是20到500bp），用於檢測與其互補的核酸序列。雙鏈內DNA加熱變性成容為單鏈，隨後用放射性同位素（通常用磷-32）、熒光染料或者酶（如辣根過氧化物酶）標記成為探針。磷-32通常被摻入組成DNA的四種核苷酸之一的磷酸基團中，而熒光染料和酶與核酸序列以共價鍵相連。
⑽ 請教波導微帶過渡——探針結構設計
我是說波導內用階梯過度到微帶的場，加工的時候一體加工，不是中間在用一個探針來過度